2015年末，全区共有医疗卫生机构509所，其中医院19所、卫生院（含分院）28所。全区共有医疗卫生技术人员5013人，各类医疗卫生机构共有床位数4624张。共建立居民健康档案76.9万份，建档率95.89%；传染病报告及时率达100%；七苗平均接种率达99.08%。区医院成为全市五个全科医生培训基地之一。
2020年6月2日，长寿区入选第五批国家慢性病综合防控示范区。
