已建成的横贯经开区的渝怀铁路(重庆至湖南怀化)为国家一级干线,在经开区内设有客运、货运站,货运能力达1100万吨/年,正在建设的复线建成后远期通货能力超过1000万吨/年,成为沟通西南、中南和华东地区的交通枢纽。
渝利铁路(重庆至湖北利川直达上海)从经开区通过,投运双层集装箱运输专用列车。渝万城际铁路从经开区穿过,到重庆主城仅需要12分钟。
已建成一条化学危险品铁路专用线,目前运输能力达120万吨/年,现正在将其扩建到830万吨/年。已建成第二条主要为钢铁产业服务的专用线,运输能力达到1450万吨,经开区第三条铁路专用线, 2013年6月建成投运,运输能力为535万吨/年。为1000万吨炼油。100万吨乙烯规划预留了铁路专用线,运输能力530万吨。